ACI VICANNE

"Modélisation dynamique et simulation des systèmes biologiques"



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Programme des 13 et 14 Septembre 2004
EVRY
Logique temporelle et model checking pour les réseaux de régulation biologiques

LUNDI 13 septembre 2004

10h-11h accueil des participants
11h-12 exposé de mise à niveau numéro 1
Introduction à la logique temporelle et au model checking
Gregory Batt
12h-14h repas (sandwiches, salades, dessert, café. sur place)
14h-15h exposé de mise à niveau numéro 2
Mise au point de modèles discrets de reéseaux de régulation biologiques par le model checking. La mucoidie chez P.aeruginosa
G.Bernot, J-P.Comet, J.Guespin
15h-15h30Pause café
14h-15h exposé de mise à niveau numéro 3
Vérification de modèles continus de réseaux de régulation biologiques par le model checking. Réseaux de régulation transcriptionnelle chez E.coli.
Gregory Batt, H. de Jong
16h30-17h30 réunion du comité scientifique de l'ACI
organisée par Jean-Pierre Mazat

MARDI 14 septembre 2004

9h-9h30 accueil des participants
9h30-12hgroupe de travail numéro 1 ( café dans la salle)
Comment écrire des propriétés biologiques en logique temporelle ?
Modérateur Gilles Bernot
La formalisation des propriétés connues ou conjecturées sur un organisme est souvent un point délicat du procesuus de modélisation et validation des réséaux de régulation. Peut-on trouver les "patterns" standard de formules qui facilitent l'expression de propriétés ? peut-on instrumenter (partiellement) une aide à l'écriture de telles formules ? quelles sont les formes les plus courantes de propriétés rencontrées ? quels sont les pièges à éviter, etc.
12h-14h repas (sandwiches, salades, dessert, café. sur place)
14h-16h30 groupe de travail numéro 2
Comment passer d'une approche qualitative à une approche plus quantitative avec des logiques temporelles ?
Modérateur Hidde De Jong
Lien avec les approches hybrides. Lien avec les délais
16h30-17hDiscussion de cloture